ABSTRACT
OBJECTIVE: We assessed herpesvirus reactivation in severe SARS-CoV-2 infection. METHODS: Retrospective study including consecutive patients admitted to an onco-hematology intensive care unit (ICU) for severe COVID-19. Replication of EBV, CMV, and HSV was evaluated. Competing risk analyses were used to assess the cumulative risk of viral reactivation, and time-dependent Cox and Fine and Gray models to assess risk factors for viral reactivation. RESULTS: Among 100 patients, 38 were immunocompromised. Sixty-three patients presented viral reactivation (12% for HSV, 58% EBV and 19% CMV). Symptomatic patients received treatment. Overall cumulative incidence of viral reactivation was 56.1% [55.9-56.4] at 10 days. After adjustment, a preexisting hematological malignancy (sHR [95%CI]=0.31 [0.11-0.85]) and solid organ transplantation (sHR [95% CI]=2.09 [1.13-3.87]) remained independently associated with viral reactivation. Viral reactivation (P=0.34) was not associated with mortality. CONCLUSIONS: Incidence of herpesvirus reactivation in patients admitted to the ICU for severe COVID-19 was high, but rarely required antiviral treatment.
Subject(s)
COVID-19 , Herpesviridae , Critical Illness , Humans , Retrospective Studies , SARS-CoV-2ABSTRACT
OBJECTIVES: The main objective of this study was to determine the incidence of invasive pulmonary aspergillosis (IPA) in patients with coronavirus disease 2019 (COVID-19) admitted to the intensive care unit (ICU), and to describe the patient characteristics associated with IPA occurrence and to evaluate its impact on prognosis. METHODS: We conducted a retrospective cohort study including all successive COVID-19 patients, hospitalized in four ICUs, with secondary deterioration and one or more respiratory samples sent to the mycology department. We used a strengthened IPA testing strategy including seven mycological criteria. Patients were classified as probable IPA according to the European Organization for Research and Treatment of Cancer (EORTC)/Mycoses Study Group Education and Research Consortium (MSGERC) classification if immunocompromised, and according to the recent COVID-19-associated IPA classification otherwise. RESULTS: Probable IPA was diagnosed in 21 out of the 366 COVID-19 patients (5.7%) admitted to the ICU and in the 108 patients (19.4%) who underwent respiratory sampling for deterioration. No significant differences were observed between patients with and without IPA regarding age, gender, medical history and severity on admission and during hospitalization. Treatment with azithromycin for >=3 days was associated with the diagnosis of probable IPA (odds ratio 3.1, 95% confidence interval 1.1-8.5, p = 0.02). A trend was observed with high-dose dexamethasone and the occurrence of IPA. Overall mortality was higher in the IPA patients (15/21, 71.4% versus 32/87, 36.8%, p < 0.01). CONCLUSION: IPA is a relatively frequent complication in severe COVID-19 patients and is responsible for increased mortality. Azithromycin, known to have immunomodulatory properties, may contribute to increase COVID-19 patient's susceptibility to IPA.
ABSTRACT
Introduction Les infections fongiques invasives (IFIs) surviennent habituellement chez le sujet immunodéprimé. Des formes d’aspergillose pulmonaires invasives (API) ont été décrites chez le sujet atteint de grippe sévère et attribué à l’association de dommages de l’épithélium respiratoire, d’anomalie de la clairance muco-ciliaire et d’une paralysie immunitaire transitoire. Les formes sévères de COVID-19 combinent également ces facteurs physiopathologiques clés. Les critères diagnostiques des IFIs chez le patient en réanimation et particulièrement dans les cas de COVID-19 ne sont pas complètement validés et leur interprétation peut mésestimer l’incidence de ces infections/colonisations. L’objectif est d’évaluer l’incidence des IFIs chez les patients hospitalisés en réanimation pour COVID-19 et de discuter l’utilisation des différents marqueurs et critères mycologiques disponibles. Matériels et méthodes Cent trois patients hospitalisés dans 4 réanimations du 15 mars au 30 avril 2020 pour détresse respiratoire avec une RT-PCR SARS-CoV-2 positive et pour qui≥1 prélèvement respiratoire a été reçu au laboratoire de mycologie ont été inclus. Sur chaque prélèvement : – une culture ;– une PCR Aspergillus ;– une PCR Pneumocystis ;– le dosage du galactomannane (GM) (LBA uniquement) était réalisé. Les marqueurs sériques ß-D-glucanes (BDG), GM, ADN aspergillaire ont été testés en parallèle. Les patients ont été classés en IFI selon la classification EORTC si des facteurs d’hôte étaient présents et selon la récente classification proposée des aspergilloses invasives associées au COVID-19 (AIAC). Résultats Un total de 27 patients présentait des critères mycologiques d’aspergillose concordant avec une API probable (n=22) selon les critères AIAC (n=20/22) et EORTC (n=2/22), une colonisation aspergillaire (n=2) ou uniquement des BDG isolés (n=3). Parmi les API probables, la culture était positive dans 88,1 % (18/22) des cas. La PCR aspergillaire et le GM (≥ 1) sur le prélèvement respiratoire était positifs dans 50,0 % (11/22) (Ct moyen=29,5) et 21,4 % (3/14) respectivement. La PCR aspergillaire, BDG (≥80pg/mL) et GM (≥ 0,5) sérique étaient positifs dans 11,8 % (3/19), 52,6 % (10/19) et 15,8 % (3/19) respectivement. La mortalité était plus important dans le groupe API probable (68,1 % vs 34,5 %, p<0,01) et s’élève à 90,0 % dans le groupe avec un BDG≥80pg/mL. La PCR Pneumocystis dans les prélèvements respiratoires était positive chez 9 patients avec des Ct moyen de 32,8 (±2,6) témoin d’une charge fongique faible-intermédiaire. Conclusion Nous retrouvons une prévalence importante de patients COVID-19 sévère présentant une co-infection aspergillaire (21,4 %), un portage de Pneumocystis (8,7 %) ou les deux (3,8 %). La performance des marqueurs est variable et peu étudiée dans cette population et nécessite plus d’investigations. Le BDG pourraient être utiles dans la différenciation infection versus colonisation. L’analyse détaillée des données cliniques est en cours afin d’évaluer les facteurs de risque de développer une AIAC chez les patients COVID-19.